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Hallo!
Ich habe bisher 1.6-ext genutzt, und will nun das AMI von 2.1.0 ausprobieren. Dazu schaue ich mir die tutorials an und versuche meinen Testfall zu übersetzen. Es ist ziemlich katastrophal, weil ohne Anleitung ist man wie ein Blinder im Dunkeln.

Zu meinem Problem: Für paralleles Rechnen will ich die metis-methode nutzen. Das hat in extend prima geklappt. Jetzt jedoch nicht mehr:

Code:

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--> FOAM FATAL ERROR:
You are trying to use metis but do not have the metisDecomp library loaded.
This message is from the dummy metisDecomp stub library instead.

Please install metis and make sure that libmetis.so is in your LD_LIBRARY_PATH.
The metisDecomp library can then be built from $FOAM_SRC/parallel/decompose/metisDecomp and dynamically loading or linking this library will add metis as a decomposition method.
Please be aware that there are license restrictions on using Metis.

    From function labelList metisDecomp::Decompose(const pointField&, const scalarField&)
    in file dummyMetisDecomp.C at line 108.

FOAM exiting

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Installiert habe ich 2.1.0 auf dem aktuellen ubuntu 11.10. Nach der obigen Fehlermeldung versuchte ich metis mit wmake zu kompilieren, funktionierte jedoch nicht. Genauso funktionierte " ./Allmake" nicht.
Mein Verdacht: OF wird automatisch in /opt/ installiert und nicht in das Home-Verzeichnis. Probehalber habe ich den installationsordner ins home-verzeichnis kopiert, dort konnte ich wmake problemlos anwenden! Das hilft aber natürlich nicht, weil alle Verknüpfungen sich auf die originäre Installation beziehen.

Habt ihr eine Idee was ich tun kann? z.B. wie man 2.1.0 im homeverzeichnis installieren kann (Da, wo es meiner Meinung nach auch eigentlich hingehört)?

Beste Grüße
Christian

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Schon mal mit Rootrechten versucht in deinem /opt/ Ordner wmake auszuführen. Ggf. könntest du noch versuchen mit chmod deine Rechte am kompletten Ordner ändern.

Grüße Tobi

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Mit Rootrechten hab ich es schon einmal probiert, da lief es auch fehlerhaft. aber chmod habe ich noch nicht getestet. Danke, werde es gleich mal probieren!

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Würd mich interessieren ob es funktioniert hat 

Code:

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chmod -R 777

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Gibts Anlässe wieso du OF in opt kompiliert hast?

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Der Anlass ist gut..ähem: Wenn man OF für Ubuntu als Deb-pack wählt, (siehe OF-Page)wird es automatisch dort installiert. 1.6 extend damals war sehr umständlich zu installieren. es sollte diesmal unkompliziert sein! bin ja irgendwie selber schuld..

es hat übrigens teilweise funktioniert. Hab das komplette Allwmake durchlaufen lassen, aber metis funktioniert dennoch nicht.
Dann noch einmal nur für metis selber, folgendes:

Code:

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root@christian-X55SV:/opt/openfoam210/src/parallel/decompose# ls
Allwmake  AllwmakeLnInclude  decompose  decompositionMethods  metisDecomp  ptscotchDecomp  scotchDecomp
root@christian-X55SV:/opt/openfoam210/src/parallel/decompose# ./Allwmake
./Allwmake: 14: /bin/foamEtcFile: not found

Error: no config/scotch.sh settings

+ wmakeLnInclude decompositionMethods
./Allwmake: 1: wmakeLnInclude: not found
+ [ -n  ]
+ echo

+ echo Skipping scotchDecomp (ptscotchDecomp)
Skipping scotchDecomp (ptscotchDecomp)
+ echo

+ wmake libso decompositionMethods
./Allwmake: 1: wmake: not found
+ wmake libso decompose
./Allwmake: 1: wmake: not found
root@christian-X55SV:/opt/openfoam210/src/parallel/decompose# ./AllwmakeLnInclude
+ wmakeLnInclude decompositionMethods
./AllwmakeLnInclude: 1: wmakeLnInclude: not found
+ wmakeLnInclude metisDecomp
./AllwmakeLnInclude: 1: wmakeLnInclude: not found
+ wmakeLnInclude scotchDecomp
./AllwmakeLnInclude: 1: wmakeLnInclude: not found
+ wmakeLnInclude ptscotchDecomp
./AllwmakeLnInclude: 1: wmakeLnInclude: not found
root@christian-X55SV:/opt/openfoam210/src/parallel/decompose# cd metisDecomp/
root@christian-X55SV:/opt/openfoam210/src/parallel/decompose/metisDecomp# ls
lnInclude  Make  metisDecomp.C  metisDecomp.H
root@christian-X55SV:/opt/openfoam210/src/parallel/decompose/metisDecomp# wmake
Der Befehl »wmake« wurde nicht gefunden, meinten Sie vielleicht:
Befehl »tmake« aus dem Paket »tmake« (universe)
Befehl »wmaker« aus dem Paket »wmaker« (universe)
Befehl »jmake« aus dem Paket »dist« (universe)
Befehl »hmake« aus dem Paket »hmake« (universe)
Befehl »imake« aus dem Paket »xutils-dev« (main)
Befehl »mmake« aus dem Paket »mmake« (universe)
Befehl »omake« aus dem Paket »omake« (universe)
Befehl »make« aus dem Paket »make« (main)
Befehl »dmake« aus dem Paket »dmake« (main)
Befehl »vmake« aus dem Paket »hdf4-tools« (universe)
Befehl »cmake« aus dem Paket »cmake« (main)
Befehl »pmake« aus dem Paket »pmake« (main)
Befehl »qmake« aus dem Paket »qt4-qmake« (main)
Befehl »qmake« aus dem Paket »qt3-dev-tools« (main)
wmake: Befehl nicht gefunden.
root@christian-X55SV:/opt/openfoam210/src/parallel/decompose/metisDecomp# ^C

---

Dann muss es halt mit "hierarchical" gehen. oder ich source extend und "dekompostiere"  es damit...

[Diese Nachricht wurde von ChristianE36 am 11. Mrz. 2012 editiert.]

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---

/bin/foamEtcFile: not found

Gibts die Datei bei dir?
Bei mir ist die vorhanden und ich kann mit wmake alles kompilieren.

Ggf. mit

Code:

---

wclean

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im metis Ordner aufräumen. Aber scotch läuft wohl auch nicht, weil er da auch was nicht findet.
Sonst funktioniert alles? Schon mal den foamSystemCheck/InstallationCheck geamcht?

[Diese Nachricht wurde von Shor-ty am 11. Mrz. 2012 editiert.]

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---

Okay, etwas seltsam:

Code:

---

christian@christian-X55SV:~$ foamInstallationTest
Executing /opt/openfoam210/bin/foamInstallationTest:

Checking basic setup...
-------------------------------------------------------------------------------

FATAL ERROR: OpenFOAM environment not configured.

    Please refer to the installation section of the README file:
    <OpenFOAM installation dir>/OpenFOAM-2.1.0/README
    to source the OpenFOAM environment.

---

Tutorials z.B. funktionieren aber sehr wohl.
Lustig ist auch, dass es die Datei "foamEtcFile" durchaus gibt. Naja, vielleicht richtet chmod es dann ja gleich.

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So, habe als root mit chmod alles freigeben. dann wclean und wmake im metis Ordner.
Allwmake funktioniert immerhin. aber wmake liefert im metis Ordner:

Code:

---

christian@christian-X55SV:/opt/openfoam210/src/parallel/decompose/metisDecomp$ ls
lnInclude  Make  metisDecomp.C  metisDecomp.H
christian@christian-X55SV:/opt/openfoam210/src/parallel/decompose/metisDecomp$ wclean
christian@christian-X55SV:/opt/openfoam210/src/parallel/decompose/metisDecomp$ wmkae
wmkae: Befehl nicht gefunden.
christian@christian-X55SV:/opt/openfoam210/src/parallel/decompose/metisDecomp$ wmake
Making dependency list for source file metisDecomp.C
could not open file metis.h for source file metisDecomp.C
SOURCE=metisDecomp.C ;  g++ -m64 -Dlinux64 -DWM_DP -Wall -Wextra -Wno-unused-parameter -Wold-style-cast -Wnon-virtual-dtor -O3  -DNoRepository -ftemplate-depth-100 -I/opt/ThirdParty-2.1.0/metis-5.0pre2/include -I../../dummyThirdParty/metisDecomp -I../decompositionMethods/lnInclude -IlnInclude -I. -I/opt/openfoam210/src/OpenFOAM/lnInclude -I/opt/openfoam210/src/OSspecific/POSIX/lnInclude  -fPIC -c $SOURCE -o Make/linux64GccDPOpt/metisDecomp.o
metisDecomp.C:34:22: schwerwiegender Fehler: metis.h: Datei oder Verzeichnis nicht gefunden
Kompilierung beendet.
make: *** [Make/linux64GccDPOpt/metisDecomp.o] Fehler 1
christian@christian-X55SV:/opt/openfoam210/src/parallel/decompose/metisDecomp$

---

"metis.h" gibt es nicht, nur "metisDecomp.H". Ich probiere weiter.

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Gib mal

Code:

---

./Allwmake 2>error.log & 1>log

---

ein und Upload doch mal deine Error-Log

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---

error.log für Allwmake aus dem Ordner decompose:

Code:

---

+ wmakeLnInclude decompositionMethods
+ [ -n /opt/ThirdParty-2.1.0/platforms/linux64Gcc/scotch_5.1.11 ]
+ wmake libso scotchDecomp
+ [ -d /opt/openfoam210/platforms/linux64GccDPOpt/lib/openmpi-system ]
+ wmakeMpiLib ptscotchDecomp
+ set +x
+ wmake libso decompositionMethods
+ wmake libso decompose

---

Der foamInstallationTest sagt übrigens nach wie vor:

Code:

---

christian@christian-X55SV:~/OpenFOAM/christian-2.1.0$ foamInstallationTest
Executing /opt/openfoam210/bin/foamInstallationTest:

Checking basic setup...
-------------------------------------------------------------------------------

FATAL ERROR: OpenFOAM environment not configured.

    Please refer to the installation section of the README file:
    <OpenFOAM installation dir>/OpenFOAM-2.1.0/README
    to source the OpenFOAM environment.

---

Nichtsdestotrotz kann ich aber simulationen durchführen. Die bashrc wird soweit korrekt initialisiert.

[Diese Nachricht wurde von ChristianE36 am 11. Mrz. 2012 editiert.]

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Hey,...
glaub ich hab dir die falsche Log gegeben  Poste doch mal noch die andere. Schon mal in der Readme-Datei gelesen, was da drin steht?

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Readme hilft auch nicht weiter. ist nur der verweis auf OF-Homepage. (userguide etc.).
Ich habe aber etwas anderes mal gemacht:
OpenFOAM 2.1.x installiert! foamInstallationTest sagt:

Code:

---

christian@christian-X55SV:~/OpenFOAM/christian-2.1.0/P3Dstat$ foamInstallationTest
Executing /home/christian/OpenFOAM/OpenFOAM-2.1.x/bin/foamInstallationTest:

Checking basic setup...
-------------------------------------------------------------------------------
Shell:              bash
Host:              christian-X55SV
OS:                Linux version 3.0.0-16-generic
-------------------------------------------------------------------------------

Checking main OpenFOAM env variables...
-------------------------------------------------------------------------------
Environment_variable Set_to_file_or_directory                Valid      Crit
-------------------------------------------------------------------------------
$WM_PROJECT_INST_DIR /home/christian/OpenFOAM                yes      yes
$WM_PROJECT_USER_DIR /home/christian/OpenFOAM/christian-2.1.x  no        no
$WM_THIRD_PARTY_DIR  .../christian/OpenFOAM/ThirdParty-2.1.x  yes      yes
-------------------------------------------------------------------------------

Checking the OpenFOAM env variables set on the PATH...
-------------------------------------------------------------------------------
Environment_variable Set_to_file_or_directory                Valid Path Crit
-------------------------------------------------------------------------------
$WM_PROJECT_DIR      /home/christian/OpenFOAM/OpenFOAM-2.1.x  yes  yes  yes

$FOAM_APPBIN        ...-2.1.x/platforms/linux64GccDPOpt/bin  yes  yes  yes
$FOAM_SITE_APPBIN    .../2.1.x/platforms/linux64GccDPOpt/bin  no        no
$FOAM_USER_APPBIN    ...-2.1.x/platforms/linux64GccDPOpt/bin  no        no
$WM_DIR              ...istian/OpenFOAM/OpenFOAM-2.1.x/wmake  yes  yes  yes
-------------------------------------------------------------------------------

Checking the OpenFOAM env variables set on the LD_LIBRARY_PATH...
-------------------------------------------------------------------------------
Environment_variable Set_to_file_or_directory                Valid Path Crit
-------------------------------------------------------------------------------
$FOAM_LIBBIN        ...-2.1.x/platforms/linux64GccDPOpt/lib  yes  yes  yes
$FOAM_SITE_LIBBIN    .../2.1.x/platforms/linux64GccDPOpt/lib  no        no
$FOAM_USER_LIBBIN    ...-2.1.x/platforms/linux64GccDPOpt/lib  no        no
$MPI_ARCH_PATH      ...x/platforms/linux64Gcc/openmpi-1.5.3  no        yes
-------------------------------------------------------------------------------

Third party software
-------------------------------------------------------------------------------
Software Version  Location
-------------------------------------------------------------------------------
flex    2.5.35    /usr/bin/flex                                           
[: 460: -lt: unexpected operator
[: 460: -gt: unexpected operator
[: 460: -lt: unexpected operator
[: 460: -gt: unexpected operator
[: 460: !=: unexpected operator
gcc                /usr/bin/gcc                                           
gzip    1.3.12    /bin/gzip                                               
tar      1.25      /bin/tar                                               
icoFoam  2.1.x    ...M/OpenFOAM-2.1.x/platforms/linux64GccDPOpt/bin/icoFoam
-------------------------------------------------------------------------------

Summary
-------------------------------------------------------------------------------
Base configuration ok.
Critical systems ok.

Done

---

metis funktioniert aber auch hier nicht! es fehlt auch hier die metis.h:

Code:

---

christian@christian-X55SV:~/OpenFOAM/OpenFOAM-2.1.x/src/parallel/decompose/metisDecomp$ ls
lnInclude  Make  metisDecomp.C  metisDecomp.dep  metisDecomp.H
christian@christian-X55SV:~/OpenFOAM/OpenFOAM-2.1.x/src/parallel/decompose/metisDecomp$ wclean
christian@christian-X55SV:~/OpenFOAM/OpenFOAM-2.1.x/src/parallel/decompose/metisDecomp$ wmake
Making dependency list for source file metisDecomp.C
could not open file metis.h for source file metisDecomp.C
SOURCE=metisDecomp.C ;  g++ -m64 -Dlinux64 -DWM_DP -Wall -Wextra -Wno-unused-parameter -Wold-style-cast -Wnon-virtual-dtor -O3  -DNoRepository -ftemplate-depth-100 -I/home/christian/OpenFOAM/ThirdParty-2.1.x/metis-5.0pre2/include -I../../dummyThirdParty/metisDecomp -I../decompositionMethods/lnInclude -IlnInclude -I. -I/home/christian/OpenFOAM/OpenFOAM-2.1.x/src/OpenFOAM/lnInclude -I/home/christian/OpenFOAM/OpenFOAM-2.1.x/src/OSspecific/POSIX/lnInclude  -fPIC -c $SOURCE -o Make/linux64GccDPOpt/metisDecomp.o
metisDecomp.C:34:22: schwerwiegender Fehler: metis.h: Datei oder Verzeichnis nicht gefunden
Kompilierung beendet.
make: *** [Make/linux64GccDPOpt/metisDecomp.o] Fehler 1

---

ich mach mich mal auf die Suche mach metis.h .. welche andere log meintest du denn?

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---

--wieder ein Schritt weiter: In der metis.h steht am Anfang folgendes:

Code:

---

/* *** DUMMY VERSION of metis.h - this file should not be included if you have metis
*    installed in the correct position in $WM_THIRD_PARTY_DIR - see
*    decompositionMethods/metisDecomp/Make/options
*/

---

Wir haben also einen "Dummy". na schön, schauen wir in die thirdparty..

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---

okay, metis existiert nicht in der thirdparty. in 1.6 extend war es noch dabei. uff. hab es mal verschoben in den thirdparty ordner von 2.1.x. aber es gibt immer noch die gleiche fehlermeldung.
Könnte es daran liegen, dass die "lib" ein "AR-Archiv" sind? Ich kann sie auch nicht öffnen bzw. entpacken. weiß jemand wie es geht?

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es geht mit ar -x (siehe auch http://de.wikipedia.org/wiki/Ar_%28Unix%29  ).

Der Trick müsste nun darin bestehen, den Dummy gegen die echte metis aus extend auszutauschen. Ordner verschieben reicht aber nicht! Hat das jemand von den Profis vielleicht schon einmal gemacht?

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---

metisDecomp.zip

Jetzt hat er mir die Antwort gar nicht geschrieben:....

Also ich verwende auch 2.1.x und alles funktioniert einwandfrei!
Hier mal der Metis-Ordner der bei mir unter src/parallel/decompose/ drin ist.

Ansonsten, einfach hierarchical oder was anderes verwenden

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Danke für deinen Ordner. Sieht auf den ersten blick aus wie meiner.
welche antwort sollte ich dir denn noch schreiben?

Nun, wie ich es verstanden habe, wird OF 2.1.x ohne metis "ausgeliefert". ich teste mal deinen Ordner 

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---

Hmmm ... naja Metis hab ihc noch nie probiert aber es funktioniert "nicht

Code:

---

Calculating distribution of cells
Selecting decompositionMethod metis

--> FOAM FATAL ERROR:
You are trying to use metis but do not have the metisDecomp library loaded.
This message is from the dummy metisDecomp stub library instead.

Please install metis and make sure that libmetis.so is in your LD_LIBRARY_PATH.
The metisDecomp library can then be built from $FOAM_SRC/parallel/decompose/metisDecomp and dynamically loading or linking this library will add metis as a decomposition method.
Please be aware that there are license restrictions on using Metis.

    From function labelList metisDecomp::Decompose(const pointField&, const scalarField&)
    in file dummyMetisDecomp.C at line 108.

FOAM exiting

---

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Hallo,

als vorläufiges Fazit des Themas will ich festhalten: Zerlegung mit Metis ist von Haus aus nicht mehr vorgesehen. Dazu gibt es auch entsprechende Beiträge auf cfd.online.
Daher die Empfehlung: Auf hierarchical oder scotch ausweichen(letzteres habe ich aber noch nicht probiert).

Wenn natürlich jemand metis von extend herrüber "geschafft" hat, dann habe ich sehr großen Respekt vor dieser Leistung. Bitte melden und hier die Lösung präsentieren 

Noch einmal ein großes Lob an Shorty für seine Beiträge!

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hey,...
hab gestern nochmals mit Thomas darüber gesprochen. Auch nach einer rekompilation von OF2.1.x ging metis auch noch nicht.

Zu scotch kann ich Folgendes sagen:

Bei Verwendung von decomposePart und Solverstart muss

Code:

---

methode scotch;

---

angegeben werden. Wird sHM verwendet muss der Eintrag temporär auf

Code:

---

methode ptscotch;

---

abgeändert werden. Dies ist kein Bug von OF!!!

Grüße Tobi

PS: Danke für das Lob 

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---

Könntest du die Befehlseingabe für scotch an einem Beispiel kurz zeigen?  (vollständig mit solver, parallel mpirun usw.)

LG

PS: Hast du auch probiert, ob scotch funktioniert?

[Diese Nachricht wurde von ChristianE36 am 13. Mrz. 2012 editiert.]

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---

Hier ein Beispiel mit scotch:
Arbeite schon länger mit scotch

Code:

---

~: vim system/decomposeParDict

/*--------------------------------*- C++ -*----------------------------------*\
| =========                |                                                |
| \\      /  F ield        | OpenFOAM: The Open Source CFD Toolbox          |
|  \\    /  O peration    | Version:  2.1.x                                |
|  \\  /    A nd          | Web:      www.OpenFOAM.org                      |
|    \\/    M anipulation  |                                                |
\*---------------------------------------------------------------------------*/
FoamFile
{
    version    2.0;
    format      ascii;
    class      dictionary;
    location    "system";
    object      decomposeParDict;
}
// * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * //

numberOfSubdomains 6;    // Anzahl der Kerne

method        scotch;

simpleCoeffs
{
    n              ( 1 1 1 );
    delta          0.001;
}

hierarchicalCoeffs
{
    n              ( 4 1 1 );
    delta          0.001;
    order          xyz;
}

manualCoeffs
{
    dataFile        "";
}

distributed    no;

roots          ( );

// ************************************************************************* //

~: decomposePar
~: paraFoam -case processorX        damit kann man schauen wie die Netze gesplittet sind; wen es jemanden interessiert
~: mpirun -np 6 scalarIcoFoam -parallel

/*---------------------------------------------------------------------------*\
| =========                |                                                |
| \\      /  F ield        | OpenFOAM: The Open Source CFD Toolbox          |
|  \\    /  O peration    | Version:  2.1.0                                |
|  \\  /    A nd          | Web:      www.OpenFOAM.org                      |
|    \\/    M anipulation  |                                                |
\*---------------------------------------------------------------------------*/
Build  : 2.1.0-0bc225064152
Exec  : scalarIcoFoam -parallel
Date  : Mar 13 2012
Time  : 18:27:41
Host  : "cfd"
PID    : 6228
Case  : /home/shor-ty/OpenFOAM/shor-ty-2.1.0/run/karmanScalarIcoFoamShorty
nProcs : 6
Slaves :
5
(
"cfd.6229"
"cfd.6230"
"cfd.6231"
"cfd.6232"
"cfd.6233"
)

Pstream initialized with:
    floatTransfer    : 0
    nProcsSimpleSum  : 0
    commsType        : nonBlocking
sigFpe : Enabling floating point exception trapping (FOAM_SIGFPE).
fileModificationChecking : Monitoring run-time modified files using timeStampMaster
allowSystemOperations : Disallowing user-supplied system call operations

// * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * //
Create time

Create mesh for time = 0

Reading transportProperties

Reading field p

Reading field U

Reading field S (added Scalar)

Reading/calculating face flux field phi

Starting time loop

Time = 0.00025

Courant Number mean: 8.34061e-05 max: 0.0374354
DILUPBiCG:  Solving for Ux, Initial residual = 1, Final residual = 1.07011e-06, No Iterations 1
DILUPBiCG:  Solving for Uy, Initial residual = 0, Final residual = 0, No Iterations 0
DICPCG:  Solving for p, Initial residual = 1, Final residual = 9.64139e-07, No Iterations 385
time step continuity errors : sum local = 1.6083e-10, global = 2.0677e-12, cumulative = 2.0677e-12
DICPCG:  Solving for p, Initial residual = 0.00621561, Final residual = 9.92286e-07, No Iterations 266
time step continuity errors : sum local = 1.08584e-07, global = -8.08585e-10, cumulative = -8.06517e-10
DILUPBiCG:  Solving for S, Initial residual = 1, Final residual = 8.36312e-07, No Iterations 1
ExecutionTime = 0.74 s  ClockTime = 1 s

Time = 0.0005

Courant Number mean: 0.060625 max: 0.912404
DILUPBiCG:  Solving for Ux, Initial residual = 0.982008, Final residual = 1.20023e-06, No Iterations 3
DILUPBiCG:  Solving for Uy, Initial residual = 0.335601, Final residual = 4.49086e-06, No Iterations 4
DICPCG:  Solving for p, Initial residual = 0.00397122, Final residual = 9.10441e-07, No Iterations 309
time step continuity errors : sum local = 9.75807e-08, global = 7.8335e-10, cumulative = -2.31668e-11
DICPCG:  Solving for p, Initial residual = 0.177362, Final residual = 9.9757e-07, No Iterations 337
time step continuity errors : sum local = 3.6197e-09, global = 1.64429e-11, cumulative = -6.72388e-12
DILUPBiCG:  Solving for S, Initial residual = 0.191776, Final residual = 4.18815e-09, No Iterations 1
ExecutionTime = 1.45 s  ClockTime = 2 s

Time = 0.00075

---

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---

Wunderbar scotch-Zerlegung läuft. Wenn ich aber dann einen parallel Lauf starten möchte, kommt das hier:

Code:

---

christian@christian-X55SV:~/OpenFOAM/christian-2.1.x/P3Dstat$ decomposePar
/*---------------------------------------------------------------------------*\
| =========                 |                                                 |
| \\      /  F ield         | OpenFOAM: The Open Source CFD Toolbox           |
|  \\    /   O peration     | Version:  2.1.x                                 |
|   \\  /    A nd           | Web:      www.OpenFOAM.org                       |
|    \\/     M anipulation  |                                                 |
\*---------------------------------------------------------------------------*/
Build  : 2.1.x-7955ce0266d7
Exec   : decomposePar
Date   : Mar 13 2012
Time   : 21:38:04
Host   : "christian-X55SV"
PID    : 1320
Case   : /home/christian/OpenFOAM/christian-2.1.x/P3Dstat
nProcs : 1
sigFpe : Enabling floating point exception trapping (FOAM_SIGFPE).
fileModificationChecking : Monitoring run-time modified files using timeStampMaster
allowSystemOperations : Disallowing user-supplied system call operations

// * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * //
Create time

Time = 0
Create mesh

Calculating distribution of cells
Selecting decompositionMethod scotch

Finished decomposition in 2.7 s

Calculating original mesh data

Distributing cells to processors

Distributing faces to processors

Distributing points to processors

Constructing processor meshes

Processor 0
    Number of cells = 823860
    Number of faces shared with processor 1 = 1280
    Number of processor patches = 1
    Number of processor faces = 1280
    Number of boundary faces = 136730

Processor 1
    Number of cells = 813674
    Number of faces shared with processor 0 = 1280
    Number of processor patches = 1
    Number of processor faces = 1280
    Number of boundary faces = 120548

Number of processor faces = 1280
Max number of cells = 823860 (0.622033% above average 818767)
Max number of processor patches = 1 (0% above average 1)
Max number of faces between processors = 1280 (0% above average 1280)

Processor 0: field transfer
Processor 1: field transfer

End.

christian@christian-X55SV:~/OpenFOAM/christian-2.1.x/P3Dstat$ mpirun -np 2 MRFSimpleFoam -parallel

--> FOAM FATAL ERROR:
Trying to use the dummy Pstream library.
This dummy library cannot be used in parallel mode

    From function UPstream::init(int& argc, char**& argv)
    in file UPstream.C at line 37.

FOAM exiting

--> FOAM FATAL ERROR:
Trying to use the dummy Pstream library.
This dummy library cannot be used in parallel mode

    From function UPstream::init(int& argc, char**& argv)
    in file UPstream.C at line 37.

FOAM exiting

--------------------------------------------------------------------------
mpirun noticed that the job aborted, but has no info as to the process
that caused that situation.
--------------------------------------------------------------------------

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Ich hab schon im Ordner Thirdparty Allwmake ausgeführt. openmpi wurde dort dann auch kompiliert. Es sollte also auch da sein. Noch mehr verwundert mich auch, dass ich  zuvor testweise eine hierarchical Zerlegung mit mpirun parallel rechnen konnte.

Eine Idee, woran es liegen könnte?
LG, Christian

EDIT:
Christian versteht die Welt nicht mehr... Den ganzen Prozess habe ich eben noch einmal wiederholt. Jetzt aber funktioniert es.
Ich hab das gemacht:

Code:

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christian@christian-X55SV:~/OpenFOAM/OpenFOAM-2.1.x/src/Pstream$ ./Allwmake
+ wmake libso dummy
'/home/christian/OpenFOAM/OpenFOAM-2.1.x/platforms/linux64GccDPOpt/lib/dummy/libPstream.so' is up to date.
+ set +x

Note: ignore spurious warnings about missing mpicxx.h headers

wmake libso mpi
wmakeLnInclude: linking include files to ./lnInclude
SOURCE=UOPwrite.C ;  g++ -m64 -Dlinux64 -DWM_DP -Wall -Wextra -Wno-unused-parameter -Wold-style-cast -Wnon-virtual-dtor -O3  -DNoRepository -ftemplate-depth-100 -DOMPI_SKIP_MPICXX -I/home/christian/OpenFOAM/ThirdParty-2.1.x/platforms/linux64Gcc/openmpi-1.5.3/include -IlnInclude -I. -I/home/christian/OpenFOAM/OpenFOAM-2.1.x/src/OpenFOAM/lnInclude -I/home/christian/OpenFOAM/OpenFOAM-2.1.x/src/OSspecific/POSIX/lnInclude   -fPIC -c $SOURCE -o Make/linux64GccDPOptOPENMPI/UOPwrite.o
UOPwrite.C: In statischer Elementfunktion »static bool Foam::UOPstream::write(Foam::UPstream::commsTypes, int, const char*, std::streamsize, int)«:
UOPwrite.C:61:13: Warnung: Verwendung einer Typumwandlung im alten Stil [-Wold-style-cast]
UOPwrite.C:61:13: Warnung: Verwendung einer Typumwandlung im alten Stil [-Wold-style-cast]
UOPwrite.C:64:13: Warnung: Verwendung einer Typumwandlung im alten Stil [-Wold-style-cast]
UOPwrite.C:64:13: Warnung: Verwendung einer Typumwandlung im alten Stil [-Wold-style-cast]

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und so weiter.. die restlichen Zeilen hab ich weggelassen. Danach lief es parallel!
[Diese Nachricht wurde von ChristianE36 am 13. Mrz. 2012 editiert.]

[Diese Nachricht wurde von ChristianE36 am 13. Mrz. 2012 editiert.]

[Diese Nachricht wurde von ChristianE36 am 14. Mrz. 2012 editiert.]

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Dann läufts jetz oder? 
Wunderbar...

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