Die Prozessor-Frage ist oft auch eine philosophische Frage. Die einen schwören auf AMD die anderen eban auf Intel. Wenn das System von einem der großen OEM Hersteller wie DELL, FSC, HP oder IBM kommen soll wird AMD wahrscheinlich sowieso ausscheiden, da meines Wissens keiner dieser Hersteller eine Workstation mit AMD Athlon CPU im Sortiment hat und die Systeme mit Opteron Prozessor doch recht teuer sind. Was bei Intel zu beachten ist, ist das der Prozessor auf alle Fälle 2 MB Level-2 Cache haben sollte.
Bei den Grafikkarten würde ich eine Quadro fx1400 empfehlen.
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