Nach stundenlagem Herumprobieren habe ich nun den Fehler gefunden:
Die Skizze im Inventor war in +Z-Richtung extrudiert. Wenn ich nun die Fläche anwähle merkt der DesignModeler, dass es sich nicht mehr um eine 2D-Fläche handelt, sondern betrachtet dies als Schale.
Habe die Skizze in -Z-Richtung extrudiert, so dass die ausgewählte Fläche im DesignModeler auch bei Z=0 liegt. Nun kann ich mit meiner o.g. Methode weiterarbeiten...
Da muss man aber auch erstmal drauf kommen... 
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